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浪潮天梭高性能平台助力中国生命科研事业 (2)

发布时间:2008.04.29 04:44     来源:赛迪网    作者:一个人的战役

【系统拓扑图】

系统拓扑图


从天到小时 科研效率大提速

利用计算机进行药物筛选是针对治疗疾病的靶标——生物大分子(酶、蛋白质、受体或核酸)来筛选化学小分子库。如同是从一堆钥匙中选出匹配的钥匙来打开特定的锁一样。生物大分子好比是钥匙,药物小分子好比是锁,要选择合适的生物大分子来打开药物小分子这把锁。这就是药物研究中的锁和钥匙原理。

黄牛博士介绍,在研究过程中,要有效地利用所获得的生物学信息,来针对疾病靶标设计治疗性药物,就需要从原子水平上来掌握生物大分子的三维结构和生物功能之间的关系,而生物大分子及其环境组成的系统往往包括几万至几十万个原子,因此在这么大的数据库里面要实现“一把钥匙配一把锁”,是一项十分复杂和困难的工作,这样的研究没有高性能计算机根本不可能进行。

黄牛博士在谈到这套浪潮天梭时高兴地讲到,这套系统可提高筛选效率几十甚至上百倍。例如过去利用单个CPU的工作站对一个生物大分子进行20万个小分子库的筛选需要10多天,如今采用浪潮天梭超级计算机仅仅只要半个小时,大大提高了工作效率。

责任编辑:杨宇佳

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